施用生物肥以后需要及时覆土，避免被阳光直射；生物肥料可以与有机肥混合施用，但是不宜与化肥混合施用。生物肥料的种类繁多，使用生物肥料并不是种类越多越好。可能两种性质不同的生物肥混合使用，会降低有益菌的活性；使用生物肥与农家肥混用的时候，切忌要使用完全腐熟的农家肥。如果未完全腐熟的农家肥混合菌肥使用，会使菌肥失效，同时也会导致农作物烧根、烧苗。
精制有机肥是将畜禽粪便干燥粉碎后包装销售的商品有机肥。生物有机肥分解，不烧根，不烂苗；精制有机肥未经腐熟，直接使用后在土壤中分解，会造成烧苗。生物有机肥高温分解，楚雄生态有机肥供应商，消灭大部分病原菌和虫卵，减少病虫害的发生；精制有机肥未腐熟，楚雄生态有机肥批发，在土壤中分解，会引来地下害虫。生物有机肥中添加有益菌，由于菌群的占据作用，减少了病害的发生；由于高温干燥，精制的有机肥消灭了其中的大部分微生物。
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